• Vojni odjel Misije Republike Hrvatske pri NATO-u obavlja stručne poslove vezane za: zastupanje i predstavljanje Ministarstva i Oružanih snaga u sjedištu NATO-a i Vrhovnom zapovjedništvu savezničkih snaga za Europu u skladu s obrambenom politikom i smjernicama ministra obrane, savjetodavne poslove za veleposlanika u Misiji Republike Hrvatske pri NATO-u o svim oblicima vojnog sudjelovanja Republike Hrvatske u NATO-u i aktivnostima u Partnerstvu za mir, veze i koordinacije između institucija NATO-a i Ministarstva, provođenje aktivnosti u programu Partnerstva za mir te za organizaciju posjeta visokih dužnosnika Ministarstva i Oružanih snaga institucijama NATO-a, sudjelovanje u radu stručnih tijela (foruma, komiteta, skupina) institucija NATO-a, unapređenje odnosa Republike Hrvatske i NATO-a, predstavljanje Oružanih snaga i Ministarstva institucijama NATO-a.

• U skladu s prihvaćenim sigurnosnim standardima Republike Hrvatske i NATO-a definiranim potpisivanjem Sigurnosnog sporazuma, Republika Hrvatska i NATO razmjenjuju informacije i dokumente preko sustava Središnji registar-podregistri.

• Podregistar za prijam i pohranu informacija i dokumenata u razmjeni između Republike Hrvatske i NATO-a uz prijam, pohranu i distribuciju dokumenata svih vrsta tajnosti, u komunikaciji s NATO-om provodi i odgovara za ustroj sigurnosnih standarda koje je Republika Hrvatska preuzela potpisivanjem Sigurnosnog sporazuma s NATO-om. U tom poslu neposredno odgovara Središnjem registru. U svezi s navedenim poslovima surađuje sa svim upravama Ministarstva, i s Podregistrom NATO-a u Glavnom stožeru.

• Uprava za ljudske resurse upravna je organizacija u sastavu Ministarstva koja obavlja upravne i druge stručne poslove vezane za: osiguravanje jedinstvenog upravljanja službenicima i namještenicima, djelatnim, ročnim i pričuvnim vojnim sastavom potrebnim za popunu Ministarstva i Oružanih snaga od uvođenja u evidenciju, školovanja i raspoređivanja do umirovljenja, odnosno brisanja iz vojne evidencije svih kategorija vojnih osoba, službenika i namještenika, usmjerava i usklađuje rad službi u svom sastavu, sudjeluje u pripremi i brine se o provođenju politike upravljanja osobljem Ministarstva, planira, usmjerava i nadzire upravljanje osobljem i profesionalni razvoj pripadnika Oružanih snaga, planira, organizira i nadzire zdravstvenu i veterinarsku zaštitu u Ministarstvu i Oružanim snagama, upravlja stambenom imovinom i skrbi o stambenom zbrinjavanju pripadnika Ministarstva i Oružanih snaga, sudjeluje u donošenju ustrojstvenih rješenja Ministarstva i Oružanih snaga, sudjeluje u pripremi i izradi nacrta zakonskih i podzakonskih propisa koji se odnose na ljudske resurse te obavlja i druge poslove koje joj povjeri ministar.

• Odjel za koordinaciju usklađuje rad unutarnjih ustrojstvenih jedinica Uprave za ljudske resurse po nalogu pomoćnika ministra, koordinira rad Uprave s drugim ustrojstvenim jedinicama Ministarstva i Oružanih snaga, savjetuje pomoćnika ministra u stvarima iz djelokruga rada Uprave, pregledava i kontrolira akte koje potpisuje pomoćnik ministra, obavlja stručne, administrativne, opće, tehničke i pomoćne poslove, objedinjuje i izrađuje planove rada Uprave za ljudske resurse na osnovi prijedloga planova rada službi, sačinjava i objedinjuje izvješća o izvršenju planova rada Uprave na osnovi izvješća službi, organizira prijam, evidenciju, rješavanje, pohranu i otpremu pošte, priprema materijale za sastanke i kolegije za pomoćnika ministra, razmjenjuje informacije s tijelima izvan sustava Ministarstva te obavlja druge poslove po nalogu pomoćnika ministra.

• Odjel raščlambe i integracije raščlanjuje, planira i razvija integracijske modele sustava upravljanja ljudskim resursima, izrađuje planske i programske dokumente, upravlja integracijom procesa sustava upravljanja ljudskim resursima te sudjeluje u izradi programskih smjernica i usklađivanju zakonske regulative.